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Matthias Burwinkel studierte Wirtschaftsingenieurwesen mit den Schwerpunkten Produktionstechnologie sowie Innovations- und Projektmanagement an der Universität Bremen. Er promovierte an der Universität Bremen mit einer Arbeit zur Modularisierung und zum Plattformmanagement von Automatisierungssystemen.

Von 2011 bis 2018 war er in der Windenergieindustrie tätig und leitete ein Werk zur Produktion von Stahlrohrtürmen und Gründungsstrukturen für Onshore- und Offshore-Windenergieanlagen. Seit 2018 ist er Geschäftsführer des LogDynamicsLab an der Universität Bremen. Von 2021 bis 2026 leitete er die BIBA-Forschungshalle.

Seit Juli 2026 leitet Matthias Burwinkel am BIBA die interdisziplinäre Forschungsgruppe „Energiesysteme und industrielle Transformation“ und verantwortet die institutsweite Geschäftsfeldentwicklung Auftragsforschung und Industriekooperationen.

Energiesysteme und industrielle Transformation; Gestaltung und Transformation industrieller Wertschöpfungssysteme unter Energieunsicherheit; integrierte Wertschöpfungs-, Energie- und Informationssysteme; energieorientierte Produktionsplanung und -steuerung; Forschungs- und Transferinfrastrukturen